I mammiferi vengono collezionati sin dalla fondazione del museo. Sono di particolare pregio singoli esemplari di orso, lince, lupo e gipeto, i quali documentano l'estinzione di queste specie nel XIX secolo. Anche una pecora di Tavetsch originale del 1902 è una testimonianza di una razza estinta. Ampie serie di corna documentano il ritorno dei grandi ungulati. Dal 1970 vengono collezionati sistematicamente anche i piccoli mammiferi (roditori, insettivori, piccoli carnivori). Questa collezione figura tra quelle più complete dell'intero arco alpino. Anche le collezioni di pesci, anfibi e rettili sono notevoli.
Molte collezioni di invertebrati sono antiche. Sono significative dal punto di vista scientifico diverse collezioni del Parco nazionale o ad esempio la collezione di farfalle di Hans Thomann nonché la collezione di gusci di lumache di Johann Peter Otto Wolf. Verranno create nuove collezioni soprattutto per quanto riguarda le api selvatiche e le farfalle diurne.